Farget PCR-plate kan brukes som sterilt DNA-RNA-FRI

Farge-PCR (fargekomplementanalyse) oversettes bokstavelig talt som"fargekomplementeringsdeteksjon", som er en slags LP-PCR. Farge-PCR har en klarere oversettelse: den bruker et fluorescerende fargestoff for å merke 5'enden av primeren. De fluorescerende fargestoffene JOE og FAM er grønn fluorescens; TAMRA er rød fluorescens; COUM er blå fluorescens. Ulike fluorescensmerkede primere deltar i reaksjonen samtidig, og det amplifiserte målgenet vil ha fargestoffet i 5'enden av primeren. Gjennom elektroforese eller sentrifugalutfelling kan det blotte øye bedømme om målgenet eksisterer og typen amplifisert gen i henhold til fargen på forskjellig fluorescens. . Vanligvis er det bare nødvendig med to primere med forskjellige farger, den ene brukes som en gendeteksjonsprimer; den andre brukes som en intern kontroll for å kontrollere betingelsene for å diagnostisere gendelesjon, kromosomal translokasjon eller infeksjon med et bestemt virus. Ved påvisning av flere punktmutasjoner kan flere farger brukes. For eksempel kan genetiske sykdommer med flere punktmutasjoner, flere mistenkte virusinfeksjoner og HLA-stedanalyse bruke farge-PCR for å oppdage flere steder samtidig.