Faryngeal vattpinne er en slags nukleinsyretest. Operasjonen av svelget er relativt enkel. Det inkluderer hovedsakelig nasofaryngeal vattpinne og orofaryngeal vattpinne. Relativt sett er deteksjonshastigheten for nasofaryngeal vattpinne høyere på grunn av nasale sekreter. Virusmengden er relativt høyere enn virusmengden av orofaryngeale sekreter.
I tillegg brukes nasopharynx til å samle sekreter. Operatøren kan stå på siden av pasienten og se direkte på pasientens munn og nesehule, og risikoen for eksponering er lav. Hvis en orofaryngeal vattpinne brukes for deteksjon, må operatøren stå foran pasienten. På den motsatte siden øker sekretene og forurensningen som lett avgis av pasientens's oppkast eller reflekser risikoen for infeksjon.